19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1213 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1213  rod shape-determining protein  100 
 
 		 180 aa  327  6e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5267  putative rod shape-determining protein MreD; putative membrane protein  71.75 
 
 		 178 aa  184  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1541  rod shape-determining protein MreD  40.67 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.110151  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0750  rod shape-determining protein MreD  44.74 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7280  hypothetical protein  36.9 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.283498 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2660  rod shape-determining protein MreD  35.4 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.381891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7283  rod shape-determining protein MreD  32.64 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0851  rod shape-determining protein MreD  44.29 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0672  rod shape-determining protein MreD  36.05 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.903722 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2466  rod shape-determining protein MreD  45.83 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1639  hypothetical protein  32.32 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000014307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  31.63 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0539  hypothetical protein  37.8 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.591389 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3463  rod shape-determining protein  36.04 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0895457  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1351  rod shape-determining protein MreD  29.06 
 
 		 172 aa  44.3  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1464  hypothetical protein  39.13 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1070  rod shape-determining protein MreD  37.93 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1538  rod shape-determining protein MreD  36.26 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.207887  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1316  hypothetical protein  32.47 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.54085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>