13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0697 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0697  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  273  6e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.756425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5920  hypothetical protein  74.36 
 
 
146 aa  176  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0396  hypothetical protein  36.05 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38532  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28320  hypothetical protein  32.63 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105269  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4613  hypothetical protein  31.07 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.787704  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2616  hypothetical protein  32 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2804  hypothetical protein  30.63 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2577  hypothetical protein  32 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2622  hypothetical protein  32 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0727892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4824  hypothetical protein  30 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139934  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0084  hypothetical protein  34.74 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1909  hypothetical protein  27.45 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.409563  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1967  hypothetical protein  34.55 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000966023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>