10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1173 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1173  flavodoxin  100 
 
 
152 aa  306  5e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1259  flavodoxin  43.06 
 
 
152 aa  118  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2461  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.46 
 
 
161 aa  107  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00792569  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2355  flavodoxin  34.01 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0227  flavodoxin  30.28 
 
 
148 aa  60.5  0.000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0261  flavodoxin  29.33 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1597  flavodoxin  29.73 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2544  flavodoxin/nitric oxide synthase  30 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000227395  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2335  hypothetical protein  31.78 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.700013 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1269  flavodoxin FldA  34.57 
 
 
162 aa  40.8  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.829769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>