33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4554 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4554  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  464  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4056  hypothetical protein  43.4 
 
 
241 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2145  hypothetical protein  42.35 
 
 
204 aa  180  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1248  hypothetical protein  29.39 
 
 
266 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0072  hypothetical protein  33.14 
 
 
222 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2873  hypothetical protein  30.67 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1967  hypothetical protein  30.37 
 
 
150 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.878388  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3450  hypothetical protein  29.63 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228768  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3627  hypothetical protein  36.36 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.805945  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3135  hypothetical protein  28.85 
 
 
348 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2522  hypothetical protein  28.85 
 
 
348 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169031  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1018  hypothetical protein  36.07 
 
 
171 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333587  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3151  hypothetical protein  28.85 
 
 
301 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.185832 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4293  hypothetical protein  28.15 
 
 
160 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.910498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4073  hypothetical protein  28.15 
 
 
150 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0151  hypothetical protein  25 
 
 
244 aa  58.9  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0643  hypothetical protein  29.41 
 
 
138 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.908214  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1332  hypothetical protein  29.51 
 
 
154 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3961  hypothetical protein  30 
 
 
155 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.599897  normal  0.163149 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3190  hypothetical protein  29.81 
 
 
349 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0127935  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0298  hypothetical protein  30.65 
 
 
149 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.532788 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3132  hypothetical protein  34.72 
 
 
350 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880988  hitchhiker  0.00102312 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6486  hypothetical protein  28.12 
 
 
301 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1682  hypothetical protein  25.19 
 
 
140 aa  55.1  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.828048  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3073  hypothetical protein  31.51 
 
 
312 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2004  hypothetical protein  29.13 
 
 
153 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.425505 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4383  hypothetical protein  28.57 
 
 
165 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.199282  hitchhiker  0.00298903 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2525  hypothetical protein  29.13 
 
 
153 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000201262  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6521  hypothetical protein  30.77 
 
 
125 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.684408 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1244  hypothetical protein  28.36 
 
 
153 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.129948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4382  hypothetical protein  24.19 
 
 
134 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29623  hitchhiker  0.00278326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0147  hypothetical protein  27.86 
 
 
143 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01120  predicted inner membrane protein  27.72 
 
 
135 aa  42  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>