14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3940 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3940  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  367  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2997  hypothetical protein  35.15 
 
 
1877 aa  132  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3933  hypothetical protein  34.34 
 
 
842 aa  124  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95807  normal  0.197732 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1672  hypothetical protein  36.21 
 
 
472 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5242  hypothetical protein  38.56 
 
 
596 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000221753  hitchhiker  0.0000000135366 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0363  hypothetical protein  33.73 
 
 
1266 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2556  hypothetical protein  31.43 
 
 
475 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0670  hypothetical protein  33.33 
 
 
1248 aa  106  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.576207  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0664  hypothetical protein  35.33 
 
 
480 aa  97.1  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411702  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1048  hypothetical protein  30.82 
 
 
512 aa  91.3  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3603  hypothetical protein  30.77 
 
 
496 aa  86.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000547172 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3161  hypothetical protein  27.88 
 
 
582 aa  77.8  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2456  hypothetical protein  23.75 
 
 
1444 aa  58.2  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0154733  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1806  hypothetical protein  21.74 
 
 
1561 aa  43.1  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>