84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2783 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2783  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  571  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0117976  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1813  hypothetical protein  54.23 
 
 		 283 aa  310  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.307669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5129  RNA binding S1 domain protein  53.9 
 
 		 276 aa  309  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1813  hypothetical protein  54.26 
 
 		 277 aa  301  6.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0500461  normal  0.539487 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11108  hypothetical protein  52.84 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1452  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.42 
 
 		 277 aa  247  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4021  hypothetical protein  45.55 
 
 		 276 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000280354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2080  RNA binding S1 domain protein  44.48 
 
 		 274 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.56309e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2136  RNA binding S1 domain protein  44.48 
 
 		 274 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000118125  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1966  hypothetical protein  40.57 
 
 		 276 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.294395  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3187  GntR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 280 aa  228  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.547241  normal  0.0826379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2056  hypothetical protein  41.55 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00868426  normal  0.106459 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1868  hypothetical protein  41.49 
 
 		 279 aa  226  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1618  hypothetical protein  42.76 
 
 		 277 aa  226  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.165792  normal  0.0266154 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1518  hypothetical protein  41.34 
 
 		 280 aa  225  6e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0135842 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1514  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.86 
 
 		 279 aa  225  8e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2610  hypothetical protein  41.84 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.129841 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2647  hypothetical protein  42.61 
 
 		 274 aa  223  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.902029  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1623  hypothetical protein  41.49 
 
 		 279 aa  223  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1630  hypothetical protein  41.13 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0406608 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4023  hypothetical protein  39.93 
 
 		 277 aa  223  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1555  hypothetical protein  41.13 
 
 		 279 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1645  hypothetical protein  41.34 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1593  hypothetical protein  41.2 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3786  RNA binding S1  41.2 
 
 		 278 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.198165  normal  0.0264698 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1803  hypothetical protein  40.99 
 
 		 280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.303771  normal  0.460129 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2519  hypothetical protein  40.99 
 
 		 280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.830114 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1759  hypothetical protein  40.99 
 
 		 280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1766  hypothetical protein  40.99 
 
 		 280 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.530453  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2281  hypothetical protein  40.14 
 
 		 277 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.014395  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003424  hypothetical protein  40.28 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.303245  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2481  hypothetical protein  42.2 
 
 		 277 aa  216  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0367564  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2579  RNA binding S1 domain protein  41.2 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.401264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3240  uncharacterized protein-like protein  43.93 
 
 		 280 aa  216  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1446  RNA binding S1  39.08 
 
 		 278 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49930  hypothetical protein  41.7 
 
 		 279 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.358542 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1697  hypothetical protein  40.43 
 
 		 277 aa  215  8e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4253  hypothetical protein  41.34 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02354  hypothetical protein  39.93 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2473  RNA binding S1 domain protein  43.32 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.728532 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16900  RNA binding protein, S1 family  40.21 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1724  hypothetical protein  38.73 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.437519  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4071  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.5 
 
 		 278 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2031  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.63 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4487  hypothetical protein  39.78 
 
 		 284 aa  205  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.830856  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3864  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.5 
 
 		 278 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4563  RNA binding S1 domain protein  39.15 
 
 		 278 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1326  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.15 
 
 		 278 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1111  hypothetical protein  37.1 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1515  nucleic acid binding protein  35.82 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1727  yitL protein  35.84 
 
 		 287 aa  193  3e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0626  hypothetical protein  36.65 
 
 		 279 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000762305  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0250  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.11 
 
 		 279 aa  175  9e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000115612  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0312  hypothetical protein  38.08 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0235  hypothetical protein  35.48 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000105707  hitchhiker  0.0000000000000116702 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0056  RNA binding S1  38.57 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1902  hypothetical protein  36.27 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000109992  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1621  hypothetical protein  35.92 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222991  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01079  hypothetical protein  34.24 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2903  RNA binding S1 domain protein  33.69 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.144767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4127  hypothetical protein  30.34 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.098552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1214  hypothetical protein  30 
 
 		 284 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1274  hypothetical protein  30.8 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.51389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1319  hypothetical protein  30.8 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.270285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1082  hypothetical protein  30.14 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1167  hypothetical protein  30.14 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1241  hypothetical protein  30.14 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1060  hypothetical protein  30.14 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1065  hypothetical protein  30.14 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1062  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.41 
 
 		 284 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425998  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0877  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.1 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1187  hypothetical protein  42.25 
 
 		 151 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0712  RNA binding S1 domain protein  24.83 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000721227  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0886  RNA binding S1 domain protein  27.82 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000369657  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1511  hypothetical protein  28.8 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00830658  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1481  hypothetical protein  26.21 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1452  hypothetical protein  26.21 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.288819  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0961  hypothetical protein  26.21 
 
 		 298 aa  75.5  0.0000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.93034  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2289  RNA-binding protein  26.62 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0752  hypothetical protein  28.08 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000115591  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1301  RNA-binding protein  29.81 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.237432  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0476  RNA-binding protein  26.8 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0883  RNA-binding protein  24.07 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000841553 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42428  predicted protein  28.87 
 
 		 252 aa  42.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>