38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2662 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2662  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  757    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3180  hypothetical protein  48.91 
 
 
362 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4800  hypothetical protein  46.85 
 
 
358 aa  332  9e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.502429  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1220  hypothetical protein  46.98 
 
 
364 aa  329  4e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4816  hypothetical protein  40.5 
 
 
457 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3406  catalase  40.22 
 
 
364 aa  259  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1687  hypothetical protein  38.25 
 
 
362 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.716667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3086  catalase  40.5 
 
 
364 aa  259  7e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1393  hypothetical protein  38.33 
 
 
363 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21911  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0829  hypothetical protein  37.92 
 
 
364 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322007  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0738  hypothetical protein  37.74 
 
 
455 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0869  hypothetical protein  37.64 
 
 
364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0789444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3994  hypothetical protein  38.06 
 
 
362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368177  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0795  hypothetical protein  39.22 
 
 
364 aa  243  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  0.0287536 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5311  catalase  40.06 
 
 
381 aa  238  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6095  catalase  38.08 
 
 
360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7585  Catalase  37.08 
 
 
358 aa  233  6e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4064  hypothetical protein  35.16 
 
 
388 aa  227  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0319  catalase  36.99 
 
 
360 aa  227  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6096  catalase  34.71 
 
 
358 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3256  catalase  36.1 
 
 
356 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0658316 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2562  catalase  35.44 
 
 
359 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181116  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0318  catalase  36.19 
 
 
370 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3760  catalase  35.87 
 
 
362 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0903  catalase  34.89 
 
 
359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.822977  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4430  hypothetical protein  29.41 
 
 
384 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0122102 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2051  hypothetical protein  32.94 
 
 
383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1217  hypothetical protein  28.57 
 
 
383 aa  166  5e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.149824 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2166  hypothetical protein  32.17 
 
 
401 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0255897  hitchhiker  0.00875673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3352  hypothetical protein  32.56 
 
 
379 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39460  hypothetical protein  31.88 
 
 
379 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000677129  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1669  hypothetical protein  29.36 
 
 
388 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198868  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2246  hypothetical protein  30.15 
 
 
343 aa  142  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761361  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0531  hypothetical protein  29.66 
 
 
401 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1213  hypothetical protein  27.22 
 
 
355 aa  123  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.329567 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0826  hypothetical protein  25.47 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4741  peroxidase  23.89 
 
 
355 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198593  normal  0.744523 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  30.94 
 
 
303 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>