23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0767 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2393  transposase mutator type  86.17 
 
 
1308 bp  1152    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.401004 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2244  transposase mutator type  86.1 
 
 
1308 bp  1144    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1800  transposase mutator type  86.1 
 
 
1308 bp  1144    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.415285 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1272  transposase mutator type  86.1 
 
 
1308 bp  1144    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.773602  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1003  transposase mutator type  86.1 
 
 
1308 bp  1144    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.350517 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0767    100 
 
 
1309 bp  2595    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.794836  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0752  transposase mutator type  86.1 
 
 
1308 bp  1144    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.697824 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0649  transposase mutator type  86.1 
 
 
1308 bp  1144    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0387283 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0623  transposase mutator type  86.1 
 
 
1308 bp  1144    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00824181  normal  0.550173 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0094  transposase mutator type  86.1 
 
 
1308 bp  1144    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3590  transposase, mutator type  91.49 
 
 
1113 bp  61.9  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5496  transposase, mutator type  88.14 
 
 
1062 bp  61.9  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0512335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0454  transposase, mutator type  90.91 
 
 
1062 bp  56  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3557    89.58 
 
 
1246 bp  56  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000455542  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02800  transposase  87.04 
 
 
1260 bp  52  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02550  transposase  87.04 
 
 
1260 bp  52  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.184855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35740  von Willebrand factor type A-like protein  100 
 
 
1026 bp  52  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496633  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10460  Transposase, Mutator family  93.94 
 
 
1269 bp  50.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000746086  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10440  Transposase, Mutator family  93.94 
 
 
1269 bp  50.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000572407  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5557  transposase mutator type  96.55 
 
 
1209 bp  50.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.032396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  100 
 
 
2187 bp  50.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5356  transposase, mutator type  85.71 
 
 
1287 bp  48.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116782  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3679    87.5 
 
 
1246 bp  48.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.119841  normal  0.0704481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>