33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_4100 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5373  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  99.6 
 
 
251 aa  521  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4452  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  99.6 
 
 
251 aa  521  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4100  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  100 
 
 
251 aa  522  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.985572  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4358  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  99.6 
 
 
251 aa  521  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.619919 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4067  CDP-diacylglycerol diphosphatase  98.8 
 
 
251 aa  518  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03803  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  98.8 
 
 
251 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03752  hypothetical protein  98.8 
 
 
251 aa  518  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4149  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  99.2 
 
 
251 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4054  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  73.8 
 
 
247 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.230238  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4746  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  53.94 
 
 
265 aa  271  8.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4057  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  52.42 
 
 
265 aa  254  9e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0105  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  51.98 
 
 
265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4074  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  51.98 
 
 
265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.030551 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1835  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  43.21 
 
 
250 aa  214  7e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.296011  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1435  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  43.9 
 
 
252 aa  211  7.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.603489  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1356  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  45 
 
 
256 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2621  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  42.27 
 
 
254 aa  188  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5996  CDP-diacylglycerol diphosphatase  41.18 
 
 
307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0842  CDPdiacylglycerol diphosphatase protein  36.77 
 
 
245 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0231  CDP-diacylglycerol diphosphatase  35.69 
 
 
276 aa  149  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.198418 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2355  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  37.44 
 
 
259 aa  146  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.39236  normal  0.534814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1010  CDP-diacylglycerol diphosphatase  32.42 
 
 
262 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390977  normal  0.0675109 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5710  CDP-diacylglycerol diphosphatase  33.77 
 
 
262 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7480  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  34.39 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3221  CDP-diacylglycerol diphosphatase  31.28 
 
 
261 aa  115  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000677051 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3475  CDP-diacylglycerol diphosphatase  29.44 
 
 
249 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0490975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3452  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  29.78 
 
 
263 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4175  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  32.74 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5614  CDP-diacylglycerol pyrophosphatase  27.13 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4899  CDP-diacylglycerol diphosphatase  28.7 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4384  CDP-diacylglycerol diphosphatase  29.55 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3349  CDP-diacylglycerol diphosphatase  26.46 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427889  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4398  hypothetical protein  65.38 
 
 
103 aa  72  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>