13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3734 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3734  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4769  hypothetical protein  97.18 
 
 		 248 aa  503  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.365157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1540  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.913508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1662  tetratricopeptide TPR_4  28.94 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.399527  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0994  hypothetical protein  32.2 
 
 		 252 aa  115  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.391943 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0924  Tetratricopeptide TPR_4  30.67 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.638112  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0859  Tetratricopeptide TPR_4  30.25 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1986  putative transmembrane protein  27.39 
 
 		 251 aa  95.9  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.878282 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2498  hypothetical protein  30.99 
 
 		 253 aa  95.5  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0034451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0665  tetratricopeptide TPR_4  25.88 
 
 		 244 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0637  tetratricopeptide TPR_4  25 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 620 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4035  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>