20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3535 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03099  predicted barnase inhibitor  100 
 
 		 90 aa  181  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03050  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  181  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3535  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  181  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.984313  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0467  Barstar (barnase inhibitor)  98.89 
 
 		 90 aa  180  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4556  hypothetical protein  98.89 
 
 		 90 aa  180  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3537  hypothetical protein  98.89 
 
 		 90 aa  180  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0467  hypothetical protein  98.89 
 
 		 90 aa  180  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3722  hypothetical protein  98.89 
 
 		 90 aa  180  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3428  hypothetical protein  98.89 
 
 		 90 aa  180  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3626  hypothetical protein  75.56 
 
 		 90 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.276792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3661  hypothetical protein  75.56 
 
 		 90 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.183785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3555  barstar  75.56 
 
 		 90 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3554  barstar  75.56 
 
 		 90 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3723  hypothetical protein  75.56 
 
 		 90 aa  148  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.339149 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3675  hypothetical protein  76.4 
 
 		 94 aa  141  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4388  barstar (barnase inhibitor)  58.33 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1171  barstar  52.38 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.011703 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0488  barstar (barnase inhibitor)  52.38 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0424  barstar  52.38 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1562  Barstar (barnase inhibitor)  32.22 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.572166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>