32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3262 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02853  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  159  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000331292  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3157  putative acyl carrier protein  100 
 
 		 82 aa  159  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3444  putative acyl carrier protein  100 
 
 		 82 aa  159  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0716  phosphopantetheine-binding  100 
 
 		 82 aa  159  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3262  putative acyl carrier protein  100 
 
 		 82 aa  159  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44250  acyl-carrier protein  48.78 
 
 		 87 aa  80.9  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0229  phosphopantetheine-binding  46.15 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00664957  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2768  phosphopantetheine-binding  39.34 
 
 		 85 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  41.38 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  41.38 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  40.35 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80821  mitochondrial acyl carrier protein  38.16 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.454049  normal  0.13999 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  39.66 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  37.93 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  52.5 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  36.84 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3899  hypothetical protein  26.67 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  41.51 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  37.29 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  52.5 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  52.5 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2083  acyl carrier protein  52.94 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000417197  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  48.65 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  33.75 
 
 		 2547 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5432  acyl carrier protein, putative  36.67 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3075  acyl carrier protein  42.22 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.117369  normal  0.374768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1686  phosphopantetheine-binding  36.67 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.543187 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1836  acyl carrier protein  51.43 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000576824  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  38.64 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10032  acyl carrier protein acpA  29.58 
 
 		 87 aa  40.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2397  acyl carrier protein  51.43 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.774036  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1208  hypothetical protein  35 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000845225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>