32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3050 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3050  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  177  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.391134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1627  hypothetical protein  32.93 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2155  hypothetical protein  31.71 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000201549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1290  protein YcfR  30.49 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1971  protein YcfR  30.49 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.1704  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1313  hypothetical protein  30.49 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000232038 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1328  hypothetical protein  30.49 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000844742 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1234  hypothetical protein  29.27 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.124074  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01116  hypothetical protein  29.27 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2489  hypothetical protein  29.27 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17858  hitchhiker  0.000290126 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2014  hypothetical protein  29.27 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221755 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1235  hypothetical protein  29.27 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1492  hypothetical protein  29.27 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0142417 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2535  protein of unknown function DUF1471  29.27 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0283942  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01108  hypothetical protein  29.27 
 
 		 85 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0028  protein of unknown function DUF1471  32.91 
 
 		 85 aa  47  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.20234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3536  protein of unknown function DUF1471  33.72 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.177081  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03098  hypothetical protein  35.63 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2131  protein of unknown function DUF1471  37.65 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0022  hypothetical protein  31.65 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3538  protein YcfR  34.48 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3534  protein YcfR  34.48 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.780594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4555  protein YcfR  34.48 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.421105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0468  hypothetical protein  34.48 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3721  protein YcfR  34.48 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3427  protein YcfR  34.48 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928315  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0468  protein of unknown function DUF1471  34.48 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1844  hypothetical protein  36.59 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3553  protein YhcN  35.23 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.554775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3624  hypothetical protein  35.23 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.392206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3552  protein YhcN  35.23 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3659  hypothetical protein  35.23 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187702  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>