15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2004 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2004  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.425505 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2525  hypothetical protein  97.86 
 
 		 153 aa  281  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000201262  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01120  predicted inner membrane protein  89.84 
 
 		 135 aa  239  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1244  hypothetical protein  74.51 
 
 		 153 aa  229  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.129948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4056  hypothetical protein  28.48 
 
 		 241 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4554  hypothetical protein  29.5 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0072  hypothetical protein  26.06 
 
 		 222 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2145  hypothetical protein  31.36 
 
 		 204 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1248  hypothetical protein  27.86 
 
 		 266 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0298  hypothetical protein  26.89 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.532788 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2522  hypothetical protein  34.21 
 
 		 348 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3135  hypothetical protein  34.21 
 
 		 348 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1018  hypothetical protein  28.35 
 
 		 171 aa  41.6  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3151  hypothetical protein  31.33 
 
 		 301 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185832 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0151  hypothetical protein  24 
 
 		 244 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>