14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1640 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A1640  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  360  4e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0185618  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0691  hypothetical protein  54.6 
 
 		 165 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196808 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1756  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0265531  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1067  gifsy-2 prophage protein  40 
 
 		 177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000488797 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1139  gifsy-2 prophage protein  40 
 
 		 177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1404  gifsy-2 prophage protein  40 
 
 		 177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000325314 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0895  bacteriophage DNA packaging protein; terminase, small subunit  42 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2018  hypothetical protein  34.78 
 
 		 163 aa  88.6  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.946251 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3137  bacteriophage terminase, small subunit  36.67 
 
 		 158 aa  88.2  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000361643 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1860  bacteriophage terminase, small subunit  34.44 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318821 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3206  bacteriophage terminase, small subunit  34.44 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031617 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2079  gifsy-2 prophage protein  36.71 
 
 		 87 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1439  gifsy-2 prophage protein  36.71 
 
 		 87 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.282953 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2024  gifsy-2 prophage protein  36.71 
 
 		 87 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0390474 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>