7 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_E0009 on replicon NC_009790
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009790  EcE24377A_E0009  IS91, orf2  100 
 
 
121 aa  251  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0085  IS91, orf2  94.92 
 
 
121 aa  231  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0136313  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0101  IS91, orf2  94.02 
 
 
140 aa  228  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0062  IS91, orf2  91.45 
 
 
140 aa  222  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.906771  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0068  IS91, orf2  91.45 
 
 
140 aa  222  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.65691  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0098  IS91, Orf2  92.98 
 
 
61 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0453731  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0031  IS91 orf  91.38 
 
 
61 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>