7 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0101 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0101  IS91, orf2  100 
 
 
140 aa  293  6e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0062  IS91, orf2  94.29 
 
 
140 aa  274  4e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.906771  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0068  IS91, orf2  94.29 
 
 
140 aa  274  4e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.65691  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0085  IS91, orf2  96.69 
 
 
121 aa  243  8e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0136313  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0009  IS91, orf2  94.02 
 
 
121 aa  228  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0098  IS91, Orf2  91.8 
 
 
61 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0453731  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0031  IS91 orf  90.16 
 
 
61 aa  120  9e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>