12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1244 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1244  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  313  8e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.129948  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2004  hypothetical protein  73.57 
 
 		 153 aa  226  9e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.425505 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2525  hypothetical protein  72.86 
 
 		 153 aa  226  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000201262  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01120  predicted inner membrane protein  70.4 
 
 		 135 aa  193  7e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2145  hypothetical protein  33.05 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4056  hypothetical protein  26.49 
 
 		 241 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4554  hypothetical protein  29.17 
 
 		 232 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1248  hypothetical protein  28.17 
 
 		 266 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0072  hypothetical protein  24.65 
 
 		 222 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0151  hypothetical protein  25.97 
 
 		 244 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3961  hypothetical protein  29.82 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.599897  normal  0.163149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1018  hypothetical protein  28.8 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333587  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>