23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0335 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0335  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  320  6e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3289  protein of unknown function DUF1097  97.58 
 
 		 165 aa  314  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3306  hypothetical protein  97.58 
 
 		 165 aa  314  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00273  predicted inner membrane protein  97.58 
 
 		 165 aa  313  8e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.764997  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00276  hypothetical protein  97.58 
 
 		 165 aa  313  8e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0377  hypothetical protein  97.58 
 
 		 165 aa  312  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.656327  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0348  hypothetical protein  96.36 
 
 		 165 aa  306  9e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1496  hypothetical protein  28.4 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00154693  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1285  hypothetical protein  29.09 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0686848  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1605  hypothetical protein  30.72 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.232532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0476  hypothetical protein  26.95 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000160273  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1636  hypothetical protein  27.95 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1552  hypothetical protein  30.99 
 
 		 174 aa  42  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215305  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2293  hypothetical protein  30.86 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.271062  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0051  inner membrane protein  30.28 
 
 		 166 aa  41.2  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0519203  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2097  hypothetical protein  30.86 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01040  hypothetical protein  30.86 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2563  hypothetical protein  30.86 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.232461 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1155  hypothetical protein  30.86 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1154  hypothetical protein  30.86 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.308865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2609  protein of unknown function DUF1097  30.86 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00104485  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01033  predicted inner membrane protein  30.86 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2235  inner membrane protein YcdZ  28.68 
 
 		 170 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.800715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>