26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3789 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3789  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  432  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1113  putative lipoprotein  99.53 
 
 
237 aa  428  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02411  hypothetical protein  99.53 
 
 
237 aa  428  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2920  hypothetical protein  99.53 
 
 
239 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.999465  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02447  hypothetical protein  99.53 
 
 
237 aa  428  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2708  hypothetical protein  99.05 
 
 
239 aa  427  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1122  hypothetical protein  99.53 
 
 
237 aa  428  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2840  hypothetical protein  97.16 
 
 
239 aa  397  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2708  hypothetical protein  97.63 
 
 
237 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2805  hypothetical protein  68.27 
 
 
228 aa  271  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2939  hypothetical protein  68.78 
 
 
228 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2764  hypothetical protein  68.78 
 
 
228 aa  269  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2826  hypothetical protein  68.78 
 
 
228 aa  268  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2722  hypothetical protein  68.29 
 
 
228 aa  268  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3040  hypothetical protein  63.41 
 
 
254 aa  265  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.177948 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3652  hypothetical protein  47.26 
 
 
290 aa  181  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1225  hypothetical protein  49.47 
 
 
278 aa  178  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3050  hypothetical protein  50.26 
 
 
276 aa  178  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1151  hypothetical protein  50 
 
 
350 aa  170  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1258  hypothetical protein  50 
 
 
355 aa  170  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3628  hypothetical protein  50 
 
 
331 aa  170  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1084  hypothetical protein  41.15 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2769  hypothetical protein  41.99 
 
 
252 aa  148  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0477  prophage LambdaBa04, tape measure protein  25.53 
 
 
1311 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0454  prophage LambdaBa04, tape measure protein  25.53 
 
 
1311 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3581  TMP repeat-containing protein  26.6 
 
 
1206 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>