20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2204 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2204  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  215  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000075026  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2804  hypothetical protein  80.58 
 
 
103 aa  167  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.27938  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0089  hypothetical protein  41.58 
 
 
214 aa  80.5  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4295  hypothetical protein  41.58 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4440  hypothetical protein  39.81 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2829  hypothetical protein  32.32 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.705107 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1015  gp41  33.33 
 
 
223 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0684412  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3271  GP46  34.91 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183285  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2002  GP46  34.91 
 
 
115 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00138731  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0728  GP46  33.02 
 
 
106 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00505701  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1953  GP46  33.02 
 
 
115 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000678855  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1960  GP46  34.91 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  0.0379275 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3408  GP46  33.02 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559716  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3507  GP46  34.91 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0774755  hitchhiker  0.00450512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2575  GP46  34.91 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.029841  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1845  GP46  34.91 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00167765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3382  GP46  34.91 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000163706  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0758  GP46  34.95 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00217936  unclonable  0.00000966346 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1661  hypothetical protein  34.07 
 
 
221 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0760524  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3275  GP46  30.61 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000845593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>