17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02671 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0868  prepilin peptidase-dependent protein C  100 
 
 		 107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02632  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.510371  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2969  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02671  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.561145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0892  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2970  hypothetical protein  99.07 
 
 		 115 aa  217  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.254629  normal  0.0125225 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3039  hypothetical protein  99.07 
 
 		 107 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3143  hypothetical protein  98.13 
 
 		 107 aa  214  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0860525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4088  hypothetical protein  98.13 
 
 		 107 aa  214  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.198399  normal  0.676509 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3223  hypothetical protein  69.81 
 
 		 106 aa  158  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  0.0263221 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3209  hypothetical protein  69.81 
 
 		 106 aa  158  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.13365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3143  hypothetical protein  69.81 
 
 		 106 aa  157  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3323  hypothetical protein  69.81 
 
 		 106 aa  157  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0403449 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3266  hypothetical protein  57.69 
 
 		 107 aa  133  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3160  hypothetical protein  69.51 
 
 		 82 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.764419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3817  putative prepilin peptidase dependent protein c precursor  29.91 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630035  normal  0.0912709 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3191  hypothetical protein  29.41 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>