26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01849 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01849  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  245  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1762  flagellar FlhE family protein  99.18 
 
 
130 aa  245  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.694188  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01838  hypothetical protein  99.18 
 
 
130 aa  245  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2171  flagellar protein FlhE  99.18 
 
 
130 aa  245  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2110  flagellar protein FlhE  99.18 
 
 
130 aa  245  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1973  flagellar protein FlhE  99.18 
 
 
130 aa  245  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1754  flagellar FlhE family protein  98.36 
 
 
130 aa  242  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1309  flagellar protein FlhE  97.44 
 
 
130 aa  230  6e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.395952 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1333  flagellar protein FlhE  75.41 
 
 
130 aa  194  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000226708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1210  flagellar protein FlhE  75.41 
 
 
130 aa  194  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2067  flagellar protein FlhE  75.41 
 
 
130 aa  194  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0204062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2127  flagellar protein FlhE  75.41 
 
 
130 aa  194  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000552447 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2072  flagellar protein FlhE  75.41 
 
 
130 aa  194  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000444905 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2445  flagellar FlhE family protein  73.77 
 
 
130 aa  191  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2615  flagellar protein FlhE  96.15 
 
 
78 aa  155  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000952859 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2430  flagellar FlhE family protein  43.75 
 
 
140 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2332  flagellar protein FlhE  43.75 
 
 
140 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.296674  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2975  flagellar FlhE family protein  44.88 
 
 
134 aa  87.8  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1549  flagellar FlhE family protein  38.02 
 
 
140 aa  87.4  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1864  flagellar FlhE family protein  38.71 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2602  flagellar FlhE family protein  35.9 
 
 
135 aa  80.5  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.265111  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1521  flagellar FlhE family protein  38.94 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3703  flagellar protein flhE precursor  39.29 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0317567 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5620  flagellar protein FlhE precursor  37.5 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.78281  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27880  flagellar protein  35.34 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.431011  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2012  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>