13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2481 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2481  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  511  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3496  hypothetical protein  50.4 
 
 
264 aa  219  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1756  hypothetical protein  53.99 
 
 
271 aa  217  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0343  hypothetical protein  41.87 
 
 
258 aa  151  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.017583  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3122  hypothetical protein  39.51 
 
 
204 aa  122  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0856  hypothetical protein  25.21 
 
 
205 aa  55.8  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1072  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.3 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1134  hypothetical protein  24.7 
 
 
268 aa  50.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.61666  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2597  xylose isomerase domain-containing protein  25.99 
 
 
270 aa  49.3  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1076  hypothetical protein  23.72 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1262  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.38 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1270  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  22.66 
 
 
268 aa  43.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1499  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.28 
 
 
272 aa  42.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>