19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1475 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1475  phage transcriptional activator, Ogr/delta  100 
 
 		 79 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0527212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2769  phage transcriptional activator, Ogr/delta  69.23 
 
 		 80 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.278918  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0237  transcriptional activator Ogr/delta  52.24 
 
 		 80 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000439463  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2802  zinc-finger protein  50 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05018  hypothetical protein  39.47 
 
 		 83 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0718  phage transcriptional activator, Ogr/delta  45.45 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0220217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0358  phage transcriptional activator Ogr/delta  47.76 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2939  zinc-finger protein  53.85 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  6.930430000000001e-29 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0692  phage transcriptional activator, Ogr/delta  43.21 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1278  phage transcriptional activator, Ogr/delta  44.07 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0895  transcriptional activator Ogr/delta  44.44 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.646461  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3117  transcriptional activator Ogr/delta  45.33 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2195  Phage transcriptional activator, Ogr/Delta  36.71 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0964  putative bacteriophage transcriptional activator-related transcription regulator protein  42.62 
 
 		 73 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.809217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0359  zinc-finger protein  40.3 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1024  phage zinc-binding transcriptional activator  46.15 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0173  transcriptional activator Ogr/delta  35.85 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4868  transcriptional activator Ogr/delta  35.85 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.547602  normal  0.181017 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0741  putative phage zinc-binding transcriptional activator  37.04 
 
 		 77 aa  40.8  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>