23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0334 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0334  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  163  8e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2579  hypothetical protein  37.88 
 
 		 69 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127117  hitchhiker  0.00104858 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3806  hypothetical protein  46.43 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638343  unclonable  0.0000000198345 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3255  hypothetical protein  36.84 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2995  protein of unknown function DUF903  33.78 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0879  protein of unknown function DUF903  35.09 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02621  hypothetical protein  35.09 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4074  putative lipoprotein  35.09 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000281927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3061  putative lipoprotein  35.09 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000593312  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2950  putative lipoprotein  35.09 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0903  hypothetical protein  35.09 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3115  putative lipoprotein  35.09 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261259  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2953  putative lipoprotein  35.09 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000202648  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02660  hypothetical protein  35.09 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05819  hypothetical protein  32.31 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0926  hypothetical protein  34.85 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000581798  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3378  protein of unknown function DUF903  34.85 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1764  hypothetical protein  35.82 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1575  hypothetical protein  35.82 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000133962  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1700  hypothetical protein  36.36 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0250469  normal  0.453188 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1703  hypothetical protein  36.36 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00741738  normal  0.280007 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3179  protein of unknown function DUF903  39.66 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.854338  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3201  protein of unknown function DUF903  34.29 
 
 		 72 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00302253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>