67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0502 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  59.26 
 
 
171 aa  209  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  55.49 
 
 
173 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2465  hypothetical protein  38.12 
 
 
169 aa  104  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000697447  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1133  hypothetical protein  38.28 
 
 
228 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  32.67 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2870  hypothetical protein  29.73 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0163842 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  36.3 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  31.48 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  30.23 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  37.3 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  30.28 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  34.68 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2137  hypothetical protein  33.97 
 
 
162 aa  67  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  35.77 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  35.21 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  29.46 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  35.21 
 
 
147 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  26.87 
 
 
165 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1399  hypothetical protein  28.65 
 
 
218 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0470  hypothetical protein  26.54 
 
 
200 aa  62.8  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0466774  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  31.5 
 
 
160 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2575  hypothetical protein  27.43 
 
 
218 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0291416 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  31.11 
 
 
160 aa  58.5  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  30.57 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5943  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0572526  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  30.57 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  31.2 
 
 
160 aa  55.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0947  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  55.1  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1671  hypothetical protein  24.71 
 
 
218 aa  55.1  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0304  hypothetical protein  24.71 
 
 
218 aa  55.1  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.785913  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  32.52 
 
 
165 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  35.29 
 
 
186 aa  53.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3864  uncharacterized protein-like protein  29.17 
 
 
160 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0195  hypothetical protein  33.96 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  31.15 
 
 
165 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  27.78 
 
 
160 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02191  hypothetical protein  34.07 
 
 
150 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1148  hypothetical protein  28.9 
 
 
196 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  36.76 
 
 
181 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1386  hypothetical protein  20.98 
 
 
151 aa  50.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  29.03 
 
 
177 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  29.03 
 
 
177 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0995  hypothetical protein  30.41 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  27.54 
 
 
175 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02081  hypothetical protein  36.59 
 
 
149 aa  48.5  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.817359  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  31.62 
 
 
176 aa  48.1  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  32.17 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0515  hypothetical protein  25.41 
 
 
210 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  25.97 
 
 
163 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  31.9 
 
 
175 aa  45.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1855  hypothetical protein  23.27 
 
 
210 aa  45.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  27.08 
 
 
174 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  40 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  30.63 
 
 
174 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  41.94 
 
 
188 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  30.09 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  30.94 
 
 
169 aa  42.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4460  hypothetical protein  39.62 
 
 
192 aa  42.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  40.91 
 
 
180 aa  42.4  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  38.16 
 
 
178 aa  42  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2564  hypothetical protein  31.58 
 
 
234 aa  41.6  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.164456  hitchhiker  0.00170184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 
401 aa  41.6  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  27.16 
 
 
185 aa  41.6  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  31.13 
 
 
180 aa  41.6  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  33.73 
 
 
179 aa  41.6  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>