14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_R0021 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.610246  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0056  tRNA-Arg  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000671008  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0018  tRNA-Arg  84.93 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000134233  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0045  tRNA-Arg  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000178577  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0018  tRNA-Arg  85.71 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000528633  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0001  tRNA-Arg  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.486164 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0035  tRNA-Arg  90.24 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0049  tRNA-Arg  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0028  tRNA-Trp  96.43 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261486  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0019  tRNA-Trp  96.43 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00399304  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0012  tRNA-Trp  96.43 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0010  tRNA-Trp  96.43 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00799791 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0011  tRNA-Trp  96.43 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00579096  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0019  tRNA-Trp  96.43 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000281472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>