20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_R0013 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_R0013  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0043  tRNA-Glu  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0070  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.198719 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0006  tRNA-Glu  84.38 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0028  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0015  tRNA-Glu  96.43 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000318423  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0034  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00296097  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0043  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0040  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0068  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.196442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0065  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.363336 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0062  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0039  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.554845  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0019  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.39609  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0020  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0552602  normal  0.107747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0018  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.159981  normal  0.105667 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0026  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0141321  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0023  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0274454  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0044  tRNA-Glu  84.48 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0178536  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0045  tRNA-Glu  84.48 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000659907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>