56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3265 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3265  Rare lipoprotein B  100 
 
 		 169 aa  332  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3916  rare lipoprotein B  100 
 
 		 169 aa  332  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4547  rare lipoprotein B  70.48 
 
 		 168 aa  211  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6002  rare lipoprotein B  67.11 
 
 		 168 aa  201  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1072  rare lipoprotein B  68.71 
 
 		 167 aa  177  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0759  rare lipoprotein B  51.35 
 
 		 163 aa  153  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3785  rare lipoprotein B  52.35 
 
 		 171 aa  151  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4604  rare lipoprotein B  49.11 
 
 		 168 aa  148  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2833  rare lipoprotein B  42.51 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0423  Rare lipoprotein B  48.99 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2972  rare lipoprotein B  40.27 
 
 		 171 aa  117  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2572  Rare lipoprotein B  40.82 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136179  normal  0.613264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2982  Rare lipoprotein B  40.14 
 
 		 174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2743  putative lipoprotein B precursor transmembrane  41.5 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0217  putative lipoprotein B precursor  45.56 
 
 		 169 aa  107  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2587  rare lipoprotein B  39.64 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890824  hitchhiker  0.0000000000573442 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  38.26 
 
 		 175 aa  97.8  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0512  rare lipoprotein B  36.99 
 
 		 170 aa  93.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0480  rare lipoprotein B  39.16 
 
 		 190 aa  91.7  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0543  rare lipoprotein B  32 
 
 		 172 aa  91.7  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0233  rare lipoprotein B precursor  30.91 
 
 		 175 aa  88.6  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2156  rare lipoprotein B  31.08 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3379  rare lipoprotein B  34.91 
 
 		 183 aa  84.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000235513 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0576  rare lipoprotein B  33.99 
 
 		 183 aa  80.5  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0550  rare lipoprotein B  33.99 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0577  rare lipoprotein B  34.64 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0255  rare lipoprotein B precursor  29.45 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0369  putative lipoprotein  33.73 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2639  putative lipoprotein  33.73 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2452  putative lipoprotein  33.73 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1228  putative lipoprotein  33.73 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3414  putative lipoprotein  33.73 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3449  putative lipoprotein  33.73 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3450  putative lipoprotein  34.21 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.978876  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0622  rare lipoprotein B  32.68 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1212  putative lipoprotein  33.55 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2731  rare lipoprotein B  32.03 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0655  rare lipoprotein B  32.24 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0172  rare lipoprotein B  32.24 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3741  rare lipoprotein B  30.82 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0664658 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2444  putative lipoprotein B precursor transmembrane  31.76 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.553692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  27.1 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12210  hypothetical protein  29.94 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1120  hypothetical protein  30.12 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1721  rare lipoprotein B  28.81 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  26.45 
 
 		 172 aa  51.2  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2583  rare lipoprotein B  28.99 
 
 		 164 aa  47.8  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4813  lipoprotein, putative  30.12 
 
 		 201 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  28.93 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  28.93 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2144  rare lipoprotein B  31.61 
 
 		 173 aa  45.1  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3787  rare lipoprotein B  30 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0401  rare lipoprotein B-like protein  24.52 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258768  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4353  rare lipoprotein B  27.71 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3144  rare lipoprotein B  28.16 
 
 		 164 aa  42  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000366189  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2959  LPS-assembly lipoprotein RlpB  25.66 
 
 		 184 aa  42  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>