80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1258 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1258  protein of unknown function UPF0125  100 
 
 		 114 aa  224  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.392163  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2550  hypothetical protein  99.12 
 
 		 114 aa  223  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388009 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3372  hypothetical protein  60.95 
 
 		 117 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2003  hypothetical protein  51.28 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.176741  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3006  hypothetical protein  55.08 
 
 		 114 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2290  hypothetical protein  50.91 
 
 		 115 aa  100  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2438  hypothetical protein  50.46 
 
 		 109 aa  99.4  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2759  protein of unknown function UPF0125  52.73 
 
 		 111 aa  99.4  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3901  hypothetical protein  47.75 
 
 		 130 aa  89.4  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670112 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2059  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00416596 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2891  hypothetical protein  51.52 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000110176  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1374  hypothetical protein  42.22 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000180129  normal  0.0331818 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2978  hypothetical protein  42.22 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.620165  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3282  TGS domain-containing protein  49.25 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.268854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1301  hypothetical protein  47.83 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2464  hypothetical protein  47.83 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2410  hypothetical protein  47.83 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334233  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2770  hypothetical protein  38.71 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0970822  normal  0.121227 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2030  TGS domain-containing protein  47.83 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374864  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1530  TGS domain-containing protein  47.83 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.606843  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2776  hypothetical protein  38.71 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540115  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2902  hypothetical protein  38.71 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.288774  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1066  hypothetical protein  38.71 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.166037  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3007  hypothetical protein  38.71 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0051008  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1057  protein of unknown function UPF0125  38.71 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3858  hypothetical protein  38.71 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00445211  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02506  hypothetical protein  38.71 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.143197  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02470  hypothetical protein  38.71 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.178913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2557  TGS domain-containing protein  49.25 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2881  hypothetical protein  38.54 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2831  hypothetical protein  38.54 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0253438  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3013  hypothetical protein  38.54 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2901  hypothetical protein  38.54 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.471326 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2899  hypothetical protein  38.54 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1143  hypothetical protein  41.77 
 
 		 110 aa  52.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.31173 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2051  TGS domain-containing protein  47.83 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112773  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1461  hypothetical protein  40.85 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.245289  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0726  hypothetical protein  42.67 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.371897  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3300  protein of unknown function UPF0125  43.42 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.409729  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0965  protein of unknown function UPF0125  44.29 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0961  hypothetical protein  42.11 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1518  hypothetical protein  38.27 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3098  hypothetical protein  45.07 
 
 		 95 aa  51.2  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.355992  normal  0.371174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3688  hypothetical protein  45.45 
 
 		 94 aa  50.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.01115  normal  0.0970123 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1741  hypothetical protein  41.18 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01179  hypothetical protein  42.5 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0261135  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1704  hypothetical protein  41.86 
 
 		 110 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2340  hypothetical protein  42.65 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.948385  normal  0.128929 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1604  hypothetical protein  34.21 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.541061 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1303  protein of unknown function UPF0125  44 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0875996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1367  protein of unknown function UPF0125  44 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.590584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2433  protein of unknown function UPF0125  35.58 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.466007  normal  0.136012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1458  hypothetical protein  36.46 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1316  hypothetical protein  39.24 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0406847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2052  protein of unknown function UPF0125  38.89 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2017  hypothetical protein  42.86 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1997  hypothetical protein  42.86 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.811587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5307  hypothetical protein  43.06 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.638439  normal  0.130756 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6080  hypothetical protein  42.86 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0412  hypothetical protein  34.18 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1483  hypothetical protein  45.16 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.982053  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1279  hypothetical protein  46.27 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.637048 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3220  protein of unknown function UPF0125  54.55 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0436  hypothetical protein  34.18 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01811  hypothetical protein  39.68 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000710892  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2030  hypothetical protein  44.93 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111797  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1899  hypothetical protein  44.93 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1528  protein of unknown function UPF0125  36.84 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1618  hypothetical protein  41.46 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.92795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1907  hypothetical protein  40.26 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1592  hypothetical protein  42.25 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0506  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1859  hypothetical protein  34.38 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2625  protein of unknown function UPF0125  41.79 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1096  hypothetical protein  34.78 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311473  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3827  hypothetical protein  34.29 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0376  hypothetical protein  35 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84295  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01126  hypothetical protein  31.4 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1201  hypothetical protein  41.18 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.516143  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1754  hypothetical protein  44.44 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.592025  normal  0.982955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>