13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2456 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2456  hypothetical protein  100 
 
 		 1444 aa  2682    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0154733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2997  hypothetical protein  34.34 
 
 		 1877 aa  106  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5242  hypothetical protein  34.25 
 
 		 596 aa  97.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000221753  hitchhiker  0.0000000135366 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0363  hypothetical protein  40.88 
 
 		 1266 aa  96.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3933  hypothetical protein  31.48 
 
 		 842 aa  91.7  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95807  normal  0.197732 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0670  hypothetical protein  38.81 
 
 		 1248 aa  87.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.576207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2556  hypothetical protein  36.93 
 
 		 475 aa  85.1  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1672  hypothetical protein  37.1 
 
 		 472 aa  80.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1048  hypothetical protein  34.73 
 
 		 512 aa  77.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3603  hypothetical protein  41.48 
 
 		 496 aa  74.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000547172 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0664  hypothetical protein  32.57 
 
 		 480 aa  70.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3161  hypothetical protein  25.86 
 
 		 582 aa  61.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3940  hypothetical protein  23.75 
 
 		 178 aa  58.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>