19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0337 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0337  hypothetical protein  100 
 
 
45 aa  86.3  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207605  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1149  hypothetical protein  59.52 
 
 
47 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1439  hypothetical protein  52.38 
 
 
51 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135717  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1977  hypothetical protein  52.38 
 
 
50 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1741  hypothetical protein  52.38 
 
 
50 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869868  normal  0.0905796 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0611  hypothetical protein  62.86 
 
 
47 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0017  hypothetical protein  47.73 
 
 
48 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2809  hypothetical protein  59.46 
 
 
47 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.452798  normal  0.575 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2091  hypothetical protein  50 
 
 
51 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.141846 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2649  hypothetical protein  46.67 
 
 
50 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2850  hypothetical protein  59.46 
 
 
47 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3015  hypothetical protein  56.76 
 
 
50 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0544  hypothetical protein  45.83 
 
 
49 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.03794  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0495  hypothetical protein  52.63 
 
 
46 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6798  hypothetical protein  47.62 
 
 
83 aa  40.8  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.585232  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1643  hypothetical protein  50 
 
 
48 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1132  hypothetical protein  47.62 
 
 
48 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3377  hypothetical protein  45.24 
 
 
47 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.356732  normal  0.170123 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1121  hypothetical protein  47.62 
 
 
48 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>