16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1067 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1067  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  350  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198101  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1018  hypothetical protein  39.33 
 
 
175 aa  137  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595923  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1281  hypothetical protein  36.7 
 
 
178 aa  121  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120421  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2600  hypothetical protein  37.43 
 
 
178 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0479098  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1522  hypothetical protein  31.98 
 
 
180 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154678  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0836  hypothetical protein  34.81 
 
 
182 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000286037  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1704  hypothetical protein  33.62 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.781571  normal  0.28438 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1907  hypothetical protein  27.38 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0562  hypothetical protein  30.58 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000215418  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0999  hypothetical protein  23.64 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000078149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06280  hypothetical protein  28.25 
 
 
178 aa  63.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000337732  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1782  hypothetical protein  32 
 
 
184 aa  58.9  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3505  hypothetical protein  26.92 
 
 
174 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141922  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1041  lipoprotein, putative  25 
 
 
177 aa  53.9  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.579422  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2660  hypothetical protein  34.41 
 
 
182 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000418114  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0387  hypothetical protein  24.18 
 
 
231 aa  42.4  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>