48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1392 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1392  reductive dehalogenase anchoring protein  100 
 
 
89 aa  173  6e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000655295  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0319  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  91.01 
 
 
89 aa  160  6e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.045097  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1323  reductive dehalogenase anchoring protein  56.67 
 
 
90 aa  95.9  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.208232  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1426  reductive dehalogenase anchoring protein  48.86 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00712862  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1259  reductive dehalogenase anchoring protein  48.86 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0307  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  42.22 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1315  reductive dehalogenase anchoring protein  50 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1398  reductive dehalogenase anchoring protein  50 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0508329  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1518  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  43.02 
 
 
95 aa  67  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.217983  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1307  reductive dehalogenase anchoring protein  42.68 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1377  reductive dehalogenase anchoring protein  36.36 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1534  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  52.81 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305425  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1537  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  47.19 
 
 
90 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1527  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  43.53 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0303  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  46.38 
 
 
90 aa  61.6  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1374  reductive dehalogenase anchoring protein  43.02 
 
 
95 aa  61.6  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1319  reductive dehalogenase anchoring protein  44.19 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1544  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  41.86 
 
 
90 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1326  reductive dehalogenase anchoring protein  47.83 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0103  hypothetical protein  41.46 
 
 
98 aa  57.4  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.16047  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1363  reductive dehalogenase anchoring protein  45.21 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1429  reductive dehalogenase anchoring protein  51.52 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1521  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  37.5 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.220887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1262  reductive dehalogenase anchoring protein  42.7 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1352  reductive dehalogenase anchoring protein  38.37 
 
 
90 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1370  reductive dehalogenase anchoring protein  41.67 
 
 
93 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_98  reductive dehalogenase anchoring protein  38.64 
 
 
91 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1401  reductive dehalogenase anchoring protein  42.03 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000581103  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1339  reductive dehalogenase anchoring protein  38.55 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1313  reductive dehalogenase anchoring protein  47.62 
 
 
93 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0111  hypothetical protein  37.21 
 
 
89 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1341  reductive dehalogenase anchoring protein  40.3 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1343  reductive dehalogenase anchoring protein  40.3 
 
 
90 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0120  hypothetical protein  39.13 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0312  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  31.76 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1386  reductive dehalogenase anchoring protein  36.67 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0282  hypothetical protein  37.08 
 
 
91 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0875  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  37.08 
 
 
90 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.328345  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1558  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  45.05 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_81  reductive dehalogenase anchoring protein  37.65 
 
 
99 aa  47.4  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1435  reductive dehalogenase anchoring protein  43.02 
 
 
90 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0283  hypothetical protein  30.23 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1382  reductive dehalogenase anchoring protein  47.67 
 
 
95 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_87  reductive dehalogenase anchoring protein  34.88 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1328  reductive dehalogenase anchoring protein  36.9 
 
 
93 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0297  hypothetical protein  34.72 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00163129  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1420  reductive dehalogenase anchoring protein  37.21 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0287032  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_97  reductive dehalogenase anchoring protein  39.13 
 
 
88 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>