57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1313 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1313  reductive dehalogenase anchoring protein  100 
 
 
93 aa  175  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1537  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  68.89 
 
 
90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_98  reductive dehalogenase anchoring protein  61.11 
 
 
91 aa  117  6e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1352  reductive dehalogenase anchoring protein  63.33 
 
 
90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1544  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  61.11 
 
 
90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1262  reductive dehalogenase anchoring protein  62.22 
 
 
90 aa  111  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1401  reductive dehalogenase anchoring protein  62.22 
 
 
90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000581103  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1558  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  65.56 
 
 
90 aa  106  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0282  hypothetical protein  62.22 
 
 
91 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1326  reductive dehalogenase anchoring protein  54.84 
 
 
93 aa  104  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1435  reductive dehalogenase anchoring protein  66.28 
 
 
90 aa  102  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_103  reductive dehalogenase anchoring protein  57.78 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1429  reductive dehalogenase anchoring protein  70 
 
 
90 aa  99.4  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0303  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  67.14 
 
 
90 aa  98.6  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0277  hypothetical protein  57.3 
 
 
90 aa  97.4  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0103  hypothetical protein  52.75 
 
 
98 aa  95.9  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.16047  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0120  hypothetical protein  65.71 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1420  reductive dehalogenase anchoring protein  61.11 
 
 
90 aa  94  7e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0287032  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1343  reductive dehalogenase anchoring protein  58.82 
 
 
90 aa  92  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1518  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  51.14 
 
 
95 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.217983  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1341  reductive dehalogenase anchoring protein  58.82 
 
 
90 aa  92  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1374  reductive dehalogenase anchoring protein  48.86 
 
 
95 aa  91.3  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0875  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  55.56 
 
 
90 aa  90.9  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.328345  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0312  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  52.81 
 
 
98 aa  89  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_87  reductive dehalogenase anchoring protein  53.41 
 
 
91 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0297  hypothetical protein  59.15 
 
 
76 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00163129  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0175  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  67.78 
 
 
90 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1370  reductive dehalogenase anchoring protein  42.35 
 
 
93 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1363  reductive dehalogenase anchoring protein  42.53 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1323  reductive dehalogenase anchoring protein  48.84 
 
 
90 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.208232  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_81  reductive dehalogenase anchoring protein  42.7 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1319  reductive dehalogenase anchoring protein  47.73 
 
 
95 aa  73.9  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1527  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  45.45 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1307  reductive dehalogenase anchoring protein  43.33 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1339  reductive dehalogenase anchoring protein  45.56 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1426  reductive dehalogenase anchoring protein  40.7 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00712862  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1259  reductive dehalogenase anchoring protein  40.7 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0236  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  40.23 
 
 
92 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0319  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  45.35 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.045097  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1382  reductive dehalogenase anchoring protein  45.45 
 
 
95 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0111  hypothetical protein  42.05 
 
 
89 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1534  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  52.17 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305425  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1315  reductive dehalogenase anchoring protein  40.7 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1398  reductive dehalogenase anchoring protein  40.7 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0508329  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0127  hypothetical protein  61.54 
 
 
113 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.553071  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1392  reductive dehalogenase anchoring protein  45.35 
 
 
89 aa  53.9  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000655295  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1377  reductive dehalogenase anchoring protein  33.72 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1334  reductive dehalogenase anchoring protein  80 
 
 
33 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0307  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  34.88 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1386  reductive dehalogenase anchoring protein  36.26 
 
 
89 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0283  hypothetical protein  35.37 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_203  hypothetical protein  56.41 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0078  trichloroethene reductive dehalogenase anchoring protein, putative  29.55 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.239502  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1730  hypothetical protein  34.83 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000103931 
 
 
-
 
NC_002936  DET1521  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  32.56 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.220887  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0228  hypothetical protein  58.82 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.205621  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1328  reductive dehalogenase anchoring protein  35.71 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>