11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1305 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1147  DEAD-like helicases-like  42.41 
 
 		 859 aa  693    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1305  DEAD-like helicase  100 
 
 		 829 aa  1712    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0305495  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6719  helicase c2  36.56 
 
 		 840 aa  595  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0332  dead/deah box helicase domain-containing protein  32.19 
 
 		 845 aa  416  1e-114  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.616588  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1967  hypothetical protein  30.57 
 
 		 847 aa  378  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00196238  normal  0.91611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2436  DEAD-like helicase  25.03 
 
 		 834 aa  199  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3912  DEAD-like helicase  27.91 
 
 		 520 aa  170  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1592  helicase c2  24.71 
 
 		 861 aa  151  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4050  DEAD-like helicase  23.45 
 
 		 857 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429268  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1993  helicase c2  24.52 
 
 		 701 aa  92.4  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.214051  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  22.87 
 
 		 698 aa  44.7  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>