53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1262 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1262  reductive dehalogenase anchoring protein  100 
 
 
90 aa  173  7e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1537  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  70 
 
 
90 aa  133  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1401  reductive dehalogenase anchoring protein  68.89 
 
 
90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000581103  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1544  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  62.22 
 
 
90 aa  120  7e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1429  reductive dehalogenase anchoring protein  72.22 
 
 
90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1558  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  70 
 
 
90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_98  reductive dehalogenase anchoring protein  56.67 
 
 
91 aa  110  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1435  reductive dehalogenase anchoring protein  66.29 
 
 
90 aa  110  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1352  reductive dehalogenase anchoring protein  53.33 
 
 
90 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0175  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  72.22 
 
 
90 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0282  hypothetical protein  60 
 
 
91 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0875  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  56.67 
 
 
90 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.328345  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0120  hypothetical protein  60.27 
 
 
90 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1343  reductive dehalogenase anchoring protein  57.78 
 
 
90 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1341  reductive dehalogenase anchoring protein  57.78 
 
 
90 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1326  reductive dehalogenase anchoring protein  47.78 
 
 
93 aa  94  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_103  reductive dehalogenase anchoring protein  56.67 
 
 
90 aa  93.6  8e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0277  hypothetical protein  56.18 
 
 
90 aa  92  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0303  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  52.22 
 
 
90 aa  91.3  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0103  hypothetical protein  47.19 
 
 
98 aa  88.2  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.16047  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0297  hypothetical protein  59.15 
 
 
76 aa  87.8  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00163129  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1420  reductive dehalogenase anchoring protein  58.89 
 
 
90 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0287032  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1313  reductive dehalogenase anchoring protein  62.22 
 
 
93 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0312  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  48.86 
 
 
98 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_87  reductive dehalogenase anchoring protein  51.72 
 
 
91 aa  83.6  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1374  reductive dehalogenase anchoring protein  42.53 
 
 
95 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1518  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  41.38 
 
 
95 aa  76.6  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.217983  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_81  reductive dehalogenase anchoring protein  42.7 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1370  reductive dehalogenase anchoring protein  37.65 
 
 
93 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1323  reductive dehalogenase anchoring protein  44.44 
 
 
90 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.208232  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1363  reductive dehalogenase anchoring protein  39.44 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1319  reductive dehalogenase anchoring protein  40.23 
 
 
95 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1307  reductive dehalogenase anchoring protein  40 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1527  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  42.53 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1339  reductive dehalogenase anchoring protein  41.11 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1426  reductive dehalogenase anchoring protein  37.08 
 
 
89 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00712862  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1259  reductive dehalogenase anchoring protein  37.08 
 
 
89 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0236  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  45.78 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0111  hypothetical protein  37.5 
 
 
89 aa  57.4  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1315  reductive dehalogenase anchoring protein  40.91 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1398  reductive dehalogenase anchoring protein  40.91 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0508329  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1382  reductive dehalogenase anchoring protein  41.38 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1377  reductive dehalogenase anchoring protein  34.83 
 
 
89 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0319  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  41.57 
 
 
89 aa  52  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.045097  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1534  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  43.48 
 
 
89 aa  50.4  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305425  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1334  reductive dehalogenase anchoring protein  80 
 
 
33 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0127  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.553071  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1521  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  32.95 
 
 
89 aa  47  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.220887  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0307  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  37.35 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1392  reductive dehalogenase anchoring protein  45.59 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000655295  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_203  hypothetical protein  47.37 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1386  reductive dehalogenase anchoring protein  31.87 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0228  hypothetical protein  52.94 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.205621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>