48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2020 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2020  RNA-binding S4  100 
 
 		 262 aa  515  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2761  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.81 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0877  RNA-binding S4 domain protein  42.37 
 
 		 231 aa  151  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4044  RNA-binding S4 domain protein  33.04 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223229  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0789  RNA-binding S4  28.89 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446217  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1889  RNA-binding S4 domain-containing protein  26.77 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000373186  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1318  RNA-binding S4 domain protein  26.7 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.210837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1086  RNA-binding S4 domain protein  27.45 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000637661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0599  RNA-binding S4 domain protein  26.13 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000013354  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1012  RNA-binding S4  29.13 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865709 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05221  S4-like domain-containing protein  30.77 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1347  RNA-binding S4 domain protein  28.17 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000348222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0715  RNA-binding S4 domain-containing protein  27.8 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.369549  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1037  RNA-binding S4 domain protein  26.47 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000298489  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5081  photosystem II S4 domain-containing protein  26.69 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.673535  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4198  RNA-binding S4  28.37 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0525  RNA-binding S4  30.72 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09250  RNA-binding S4 domain protein  26.47 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0028436  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1296  hypothetical protein  30.1 
 
 		 255 aa  53.1  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3250  photosystem II S4 domain protein  27.45 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2152  RNA-binding S4  27.14 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.224826  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2846  photosystem II S4 domain protein  27.45 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4774  photosystem II S4 domain protein  27.4 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.789019 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1503  RNA-binding S4  29.08 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3724  RNA-binding S4 domain-containing protein  27.18 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195579  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0928  RNA-binding S4  22.31 
 
 		 262 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.618898  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17841  S4-like domain-containing protein  21.79 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.348814  normal  0.852292 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1243  S4 domain protein  25.38 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000893019  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0483  ylmH protein  22.99 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3998  S4 domain protein  25.38 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000894164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2321  photosystem II S4 domain protein  28.29 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0953  RNA-binding S4 domain protein  26.76 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0596  RNA-binding S4 domain-containing protein  24.9 
 
 		 261 aa  46.6  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000430784  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3949  S4 domain protein  26.15 
 
 		 255 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000108737  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2058  cell division protein  22.75 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3748  S4 domain-containing protein  28.67 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.125171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3639  S4 domain-containing protein  28.67 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000680133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3656  S4 domain-containing protein  28.67 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4036  s4 domain-containing protein  28.67 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00128697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3911  S4 domain protein  28.67 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000445845 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1820  S4 domain-containing protein  21.46 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000243371  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1907  RNA-binding S4 domain protein  26.24 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3942  S4 domain-containing protein  28.67 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131052  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41009  predicted protein  27.52 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.106009  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1140  cell division protein  23.97 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2360  RNA-binding S4 domain-containing protein  21.94 
 
 		 263 aa  42.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000894269  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15171  S4-like domain-containing protein  22.79 
 
 		 263 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2106  S4 domain-containing protein  20.98 
 
 		 253 aa  42  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00816123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>