19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1178 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1178  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  263  5e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1024  Domain of unknown function DUF1801  70.08 
 
 
152 aa  184  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.187798  normal  0.287584 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2394  hypothetical protein  61.72 
 
 
157 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000734889  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8844  hypothetical protein  64.39 
 
 
146 aa  166  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2642  hypothetical protein  61.11 
 
 
146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3434  hypothetical protein  60.47 
 
 
156 aa  161  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0744496  normal  0.059661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0555  hypothetical protein  60.47 
 
 
156 aa  158  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2079  Domain of unknown function DUF1801  58.78 
 
 
150 aa  159  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0297995  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2173  hypothetical protein  57.58 
 
 
161 aa  139  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.294686  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1217  hypothetical protein  58.56 
 
 
153 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.889377  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3371  hypothetical protein  50.39 
 
 
161 aa  133  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2344  hypothetical protein  57.39 
 
 
160 aa  132  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.612858  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0511  hypothetical protein  52.67 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0788  hypothetical protein  48 
 
 
180 aa  128  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571735  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4098  hypothetical protein  49.24 
 
 
160 aa  120  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.369529  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22220  protein of unknown function (DU1801)  38.71 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2458  Domain of unknown function DUF1801  29.03 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0934396  hitchhiker  0.00000261825 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19540  protein of unknown function (DU1801)  30.63 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275996  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3419  hypothetical protein  28.3 
 
 
120 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>