16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3682 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3682  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  318  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.130981 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1128  hypothetical protein  41.5 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0223  hypothetical protein  37.5 
 
 
135 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0750249 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1017  hypothetical protein  32.89 
 
 
157 aa  88.2  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0822  hypothetical protein  31.72 
 
 
148 aa  87.8  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.396817  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3996  hypothetical protein  34.97 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.235383  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2186  hypothetical protein  33.56 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6836  hypothetical protein  31.76 
 
 
632 aa  77.4  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000213305  normal  0.0288754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4425  hypothetical protein  30 
 
 
160 aa  77  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.613559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3191  hypothetical protein  31.91 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.849991  normal  0.210266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3699  hypothetical protein  28.75 
 
 
169 aa  57.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000290761  hitchhiker  0.000000117346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2650  hypothetical protein  26.9 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1090  hypothetical protein  24.34 
 
 
171 aa  48.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0980  hypothetical protein  24.64 
 
 
209 aa  47  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0717  hypothetical protein  33.9 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.165578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5070  hypothetical protein  25.49 
 
 
223 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.578311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>