22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3217 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3217  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  941    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6614  PhoPQ-activated pathogenicity-related protein PqaA type  62.62 
 
 		 457 aa  579  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1356  hypothetical protein  39.82 
 
 		 439 aa  319  6e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440655  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1834  PhoPQ-activated pathogenicity-related protein-like protein  36.59 
 
 		 423 aa  231  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016412  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1797  PhoPQ-activated pathogenicity-related protein-like protein  36.59 
 
 		 423 aa  229  9e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0548814  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1682  PhoPQ-activated pathogenicity-related protein-like protein  34.96 
 
 		 425 aa  204  4e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.636927  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1626  PqaA protein  28.07 
 
 		 496 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1648  PqaA protein  28.07 
 
 		 496 aa  153  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.439725  normal  0.998647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1792  PqaA protein  28.12 
 
 		 496 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.1475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1656  PqaA protein  28.07 
 
 		 496 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.568365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01585  PhoPQ-regulated protein  27.69 
 
 		 501 aa  152  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0207412  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1715  PqaA protein  27.71 
 
 		 496 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.57853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5043  hypothetical protein  25.17 
 
 		 486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4917  PhoPQ-activated pathogenicity-related protein-like protein  25.17 
 
 		 473 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05517  putative transmembrane protein  24.78 
 
 		 517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0113  PqaA  27.95 
 
 		 495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0123  PqaA protein  26.67 
 
 		 483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434037  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1596  hypothetical protein  26.67 
 
 		 495 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0977931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0147  PqaA protein  26.67 
 
 		 483 aa  127  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2842  hypothetical protein  21.63 
 
 		 494 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2286  hypothetical protein  21.11 
 
 		 494 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3028  hypothetical protein  21.28 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.346264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>