22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1366 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1366  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  496  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1620  hypothetical protein  84.19 
 
 
253 aa  387  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.614587  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1502  hypothetical protein  86.17 
 
 
253 aa  374  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0296  hypothetical protein  29.37 
 
 
256 aa  95.1  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0649  hypothetical protein  28.87 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1535  hypothetical protein  34.29 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3318  hypothetical protein  26.24 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3088  hypothetical protein  26.72 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.219174  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1707  hypothetical protein  25.7 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3348  hypothetical protein  25 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3102  hypothetical protein  25 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1747  ABC-2 type transport system permease protein  26.04 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600827  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2034  hypothetical protein  29.57 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0733845  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1979  hypothetical protein  26.67 
 
 
253 aa  62  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2114  hypothetical protein  25.57 
 
 
256 aa  56.6  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0351  hypothetical protein  30.37 
 
 
256 aa  49.7  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  26 
 
 
274 aa  45.8  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3920  bacitracin transport permease protein BCRB  31.43 
 
 
330 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  28.42 
 
 
274 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0667  hypothetical protein  28.21 
 
 
252 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  21.55 
 
 
319 aa  42.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0041  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 
259 aa  42.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>