24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1830 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1830  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  557  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4569  hypothetical protein  32.9 
 
 
241 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0247  hypothetical protein  34.26 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0297  hypothetical protein  32.31 
 
 
284 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.246483  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1483  hypothetical protein  30.73 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2427  hypothetical protein  34.65 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3192  hypothetical protein  32.42 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157621  normal  0.129544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2527  hypothetical protein  33.61 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35785  normal  0.669591 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2011  hypothetical protein  33.07 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0967  hypothetical protein  31.22 
 
 
260 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2861  hypothetical protein  30.57 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.613567  normal  0.192183 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2627  hypothetical protein  32.83 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.433366 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0115  hypothetical protein  29.36 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2069  hypothetical protein  31.4 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3920  hypothetical protein  34.36 
 
 
264 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263137  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3304  hypothetical protein  34.36 
 
 
264 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0123  hypothetical protein  34.36 
 
 
280 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3066  hypothetical protein  34.36 
 
 
273 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1536  hypothetical protein  34.36 
 
 
273 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38947  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3001  hypothetical protein  34.36 
 
 
273 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3992  hypothetical protein  33.33 
 
 
264 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0282  hypothetical protein  28.19 
 
 
226 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7643  hypothetical protein  26.48 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1493  hypothetical protein  27.95 
 
 
262 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>