14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1187 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1187  TRASH domain-containing protein  100 
 
 		 97 aa  201  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.254659  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1968  TRASH  60.64 
 
 		 100 aa  122  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1429  TRASH domain-containing protein  58.59 
 
 		 99 aa  123  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0363  TRASH domain protein  51.55 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00964883 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1349  TRASH domain protein  43.48 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.407824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1455  TRASH  42.05 
 
 		 83 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00129945  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0052  TRASH domain-containing protein  37.08 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0704  hypothetical protein  35.96 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2978  hypothetical protein  37.65 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.48983  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0623  TRASH domain protein  37.21 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.34319e-36 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0496  hypothetical protein  31.11 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0374  hypothetical protein  30.34 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.72923  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0609  TRASH domain protein  37.21 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0746  hypothetical protein  31.33 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>