14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2958 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2958  flagellar basal-body rod protein, putative  100 
 
 		 125 aa  250  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.472988  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0472  hypothetical protein  46.51 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0366232 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1322  protein of unknown function DUF1078 domain protein  45.38 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0198104 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1767  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.17 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3229  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.23 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  34.75 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.75 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  34.75 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  34.75 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  34.75 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  34.75 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  34.75 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  34.75 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  34.75 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>