22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1877 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2097  hypothetical protein  82.82 
 
 
518 aa  937    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1877  hypothetical protein  100 
 
 
519 aa  1088    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4187  hypothetical protein  34.55 
 
 
366 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.637966  hitchhiker  0.00122785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2098  hypothetical protein  39.64 
 
 
351 aa  206  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217218  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2983  hypothetical protein  33.81 
 
 
356 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3136  hypothetical protein  33.52 
 
 
356 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5171  hypothetical protein  38.22 
 
 
594 aa  191  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5987  hypothetical protein  33.62 
 
 
370 aa  186  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.373978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0631  hypothetical protein  32.56 
 
 
343 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107314  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2509  hypothetical protein  32.48 
 
 
367 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0383  hypothetical protein  25.7 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543894  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0289  hypothetical protein  24.38 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.929671  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1097  hypothetical protein  25.55 
 
 
384 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2855  hypothetical protein  25.55 
 
 
384 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2702  hypothetical protein  25.23 
 
 
384 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3755  ketosteroid isomerase-like protein  28.18 
 
 
137 aa  56.6  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2330  VioB - polyketide synthase  24.46 
 
 
1069 aa  54.7  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0866221  hitchhiker  0.0021675 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  22.52 
 
 
134 aa  47.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4291  hypothetical protein  23.85 
 
 
324 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1261  hypothetical protein  23.15 
 
 
763 aa  45.8  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3498  hypothetical protein  23.85 
 
 
138 aa  44.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.718505 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4622  hypothetical protein  21.71 
 
 
136 aa  44.3  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>