16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3483 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3483  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1209  hypothetical protein  39.73 
 
 
86 aa  71.2  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3623  hypothetical protein  56.82 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2869  hypothetical protein  55.26 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2980  hypothetical protein  36.11 
 
 
89 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4103  hypothetical protein  40 
 
 
78 aa  50.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.918286  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1434  hypothetical protein  39.19 
 
 
85 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0127  hypothetical protein  34.29 
 
 
90 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00495666  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2640  hypothetical protein  43.75 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4439  hypothetical protein  44.44 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1231  hypothetical protein  42 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7004  hypothetical protein  42 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2643  hypothetical protein  34.85 
 
 
79 aa  42  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1139  hypothetical protein  46.34 
 
 
102 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4275  hypothetical protein  40 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532653  normal  0.601848 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1907  hypothetical protein  44.44 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0497994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>