59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2580 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2580  chlorite dismutase  100 
 
 
282 aa  585  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0889379  normal  0.359618 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3545  chlorite dismutase  27.4 
 
 
232 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.84719  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1747  chlorite dismutase  25.11 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127686  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2027  chlorite dismutase  25.11 
 
 
233 aa  79  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0747  chlorite dismutase  23.4 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2261  chlorite dismutase  25.33 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.267683  normal  0.0759914 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0515  chlorite dismutase  24.37 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2827  Chlorite dismutase  25.24 
 
 
236 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6718  hypothetical protein  26.5 
 
 
235 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.232939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1554  Chlorite dismutase  24.88 
 
 
232 aa  63.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6785  Chlorite dismutase  25.62 
 
 
252 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.777367  normal  0.25282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1434  hypothetical protein  38.82 
 
 
182 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24070  hypothetical protein  25.6 
 
 
230 aa  60.1  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.84912  normal  0.0210051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2265  Chlorite dismutase  25.11 
 
 
234 aa  59.3  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.557365  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3917  chlorite dismutase  24.88 
 
 
233 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18398  normal  0.657436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2483  chlorite dismutase  22.91 
 
 
234 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.359511 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15650  hypothetical protein  24.39 
 
 
241 aa  58.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.228607  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1766  Chlorite dismutase  25.24 
 
 
238 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000058609  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1896  hypothetical protein  22.27 
 
 
233 aa  57  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.249217  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2990  Chlorite dismutase  21.84 
 
 
263 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2214  chlorite dismutase  22.03 
 
 
234 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2260  chlorite dismutase  22.03 
 
 
234 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.351607  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2203  chlorite dismutase  22.03 
 
 
234 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.451724  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12691  hypothetical protein  24.1 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.90726e-33  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2442  hypothetical protein  29.03 
 
 
183 aa  53.1  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.197854  normal  0.0996567 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1480  hypothetical protein  30.4 
 
 
186 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000534858 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4482  hypothetical protein  30.4 
 
 
186 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000016181 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1855  hypothetical protein  30.4 
 
 
186 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00770378  hitchhiker  0.000000000000348752 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6340  hypothetical protein  30.4 
 
 
186 aa  52.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192595  unclonable  0.0000000553775 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2406  Chlorite dismutase  23.21 
 
 
238 aa  52.4  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  hitchhiker  0.00264181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0151  Chlorite dismutase  24.59 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3376  hypothetical protein  27.91 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.436462  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2898  Chlorite dismutase  25.63 
 
 
223 aa  51.6  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08350  hypothetical protein  22.56 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.581992  normal  0.119836 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1894  Chlorite dismutase  23.2 
 
 
236 aa  50.4  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1089  Chlorite dismutase  25.12 
 
 
247 aa  50.4  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1891  Chlorite dismutase  22.94 
 
 
238 aa  49.7  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.297673  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1476  chlorite dismutase  24.08 
 
 
233 aa  48.9  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0166814  hitchhiker  0.00018157 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1710  chlorite dismutase  22.12 
 
 
248 aa  49.3  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2623  Chlorite dismutase  22.49 
 
 
255 aa  48.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1587  Chlorite dismutase  27.49 
 
 
243 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.06265  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3926  Chlorite dismutase  22.83 
 
 
241 aa  45.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.584137  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1534  chlorite dismutase  23.04 
 
 
233 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962183  normal  0.627551 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5483  putative heme peroxidase  22.82 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5069  putative heme peroxidase  22.82 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5086  putative heme peroxidase  22.82 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.252525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5239  putative heme peroxidase  22.82 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5517  putative heme peroxidase  22.82 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5637  putative heme peroxidase  22.82 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1336  chlorite dismutase  23.7 
 
 
231 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0486629  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3909  putative heme peroxidase  22.92 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5567  putative heme peroxidase  22.82 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1404  Chlorite dismutase  20.71 
 
 
260 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.288752 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1885  Chlorite dismutase  21.34 
 
 
241 aa  43.5  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.985614 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3671  chlorite dismutase  21.9 
 
 
240 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.161413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5440  putative heme peroxidase  22.41 
 
 
247 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5511  putative heme peroxidase  22.41 
 
 
247 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15210  hypothetical protein  20.09 
 
 
238 aa  42.7  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5181  putative heme peroxidase  22.41 
 
 
247 aa  42.7  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>