69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_6002 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_6002  rare lipoprotein B  100 
 
 		 168 aa  336  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3265  Rare lipoprotein B  67.11 
 
 		 169 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3916  rare lipoprotein B  67.11 
 
 		 169 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4547  rare lipoprotein B  66.87 
 
 		 168 aa  192  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1072  rare lipoprotein B  63.27 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3785  rare lipoprotein B  49.01 
 
 		 171 aa  154  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4604  rare lipoprotein B  50.67 
 
 		 168 aa  151  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0759  rare lipoprotein B  47.62 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2833  rare lipoprotein B  39.39 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2972  rare lipoprotein B  40.27 
 
 		 171 aa  118  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0423  Rare lipoprotein B  45.64 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2982  Rare lipoprotein B  40.14 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2572  Rare lipoprotein B  40.14 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136179  normal  0.613264 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2743  putative lipoprotein B precursor transmembrane  40.82 
 
 		 169 aa  110  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2587  rare lipoprotein B  39.52 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890824  hitchhiker  0.0000000000573442 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0543  rare lipoprotein B  38 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  39.86 
 
 		 175 aa  100  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0622  rare lipoprotein B  36.47 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3379  rare lipoprotein B  35.93 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000235513 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2156  rare lipoprotein B  35.37 
 
 		 179 aa  95.1  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0512  rare lipoprotein B  38.78 
 
 		 170 aa  94  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0217  putative lipoprotein B precursor  41.89 
 
 		 169 aa  93.6  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0172  rare lipoprotein B  37.18 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0655  rare lipoprotein B  37.18 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0576  rare lipoprotein B  37.06 
 
 		 183 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0233  rare lipoprotein B precursor  29.7 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3741  rare lipoprotein B  37.2 
 
 		 177 aa  92  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0664658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0550  rare lipoprotein B  37.06 
 
 		 183 aa  91.7  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2731  rare lipoprotein B  38.06 
 
 		 176 aa  91.7  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0577  rare lipoprotein B  35.29 
 
 		 169 aa  88.6  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2639  putative lipoprotein  32.93 
 
 		 183 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3449  putative lipoprotein  32.93 
 
 		 183 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3414  putative lipoprotein  32.93 
 
 		 183 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1228  putative lipoprotein  32.93 
 
 		 183 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0369  putative lipoprotein  32.93 
 
 		 183 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2452  putative lipoprotein  32.93 
 
 		 183 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1212  putative lipoprotein  35.67 
 
 		 176 aa  84.7  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0480  rare lipoprotein B  35.66 
 
 		 190 aa  84  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2444  putative lipoprotein B precursor transmembrane  34.87 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.553692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3450  putative lipoprotein  33.55 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.978876  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0255  rare lipoprotein B precursor  29.45 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  26.99 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1120  hypothetical protein  28.57 
 
 		 208 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  25.95 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  28.99 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  28.99 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12210  hypothetical protein  26.95 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1743  putative lipoprotein B precursor  25.33 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0430569  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1721  rare lipoprotein B  29.52 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2911  Rare lipoprotein B  26.49 
 
 		 194 aa  50.8  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  26.95 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3144  rare lipoprotein B  31.1 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000366189  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2927  LPS-assembly lipoprotein RlpB  32.03 
 
 		 207 aa  48.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2930  rare lipoprotein B  27.38 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.692064  decreased coverage  0.00636409 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3703  rare lipoprotein B  26.95 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00988017  hitchhiker  0.0000022488 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1843  LPS-assembly lipoprotein RlpB  32.03 
 
 		 207 aa  48.1  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3016  LPS-assembly lipoprotein RlpB  32.03 
 
 		 207 aa  48.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.446987  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4813  lipoprotein, putative  26.67 
 
 		 201 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0989  rare lipoprotein B precursor  24.38 
 
 		 210 aa  47.4  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0401  rare lipoprotein B-like protein  26.45 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258768  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4353  rare lipoprotein B  25.45 
 
 		 201 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01875  lipoprotein  28.28 
 
 		 181 aa  44.7  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  27.65 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2959  LPS-assembly lipoprotein RlpB  25.81 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1377  rare lipoprotein B precursor  25.99 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0925703  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3787  rare lipoprotein B  26.63 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1097  LPS-assembly lipoprotein RlpB  25.64 
 
 		 182 aa  42  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.590366  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  27.65 
 
 		 184 aa  42  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2583  rare lipoprotein B  30.36 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.446935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>